SKRINING TURUNAN FLAVONOID SEBAGAI KANDIDAT INHIBITOR PROTEASE NSP2 DARI VIRUS CHIKUNGUNYA MENGGUNAKAN MOLECULAR DOCKING

yahmin yahmin, Khoirul Faqih, Suharti Suharti

Abstract


Penelitian ini bertujuan mendapatkan senyawa turunan flavonoid yang berpotensi sebagai inhibitor protease nsP2 dari virus chikungunya (CHIKV) dengan metode molecular docking serta mengkaji interaksi senyawa turunan flavonoid hasil skrining. Hasil penelitian menunjukkan bahwa setelah melalui proses molecular docking menggunakan software PyRx 0.8, senyawa turunan flavonoid yang berpotensi sebagai inhibitor dari enam kelompok flavonoid, yaitu hesperidin, rhoifolin, myricetin, genistin, peonidin, phlorizin yang mempunyai nilai root means square deviation (RMSD) senilai 0Å dengan nilai binding affinity berturut-turut -9,4; -8,5; -8,1; -7,9; -7,6; dan -6,9 kkal/mol. Hasil visualisasi molekul secara umum menunjukkan terjadinya interaksi hidrofobik dan terbentuknya ikatan hidrogen.

Keywords


flavonoid, protease nsP2, virus chikungunya, molecular docking

Full Text:

PDF


DOI: http://dx.doi.org/10.17977/um0260v3i12019p034

Refbacks

  • There are currently no refbacks.


Copyright (c) 2019 yahmin yahmin, Khoirul Faqih, Suharti Suharti

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

     

 

JC-T Stats